As manchas de ferrugem na pedra são causadas pela oxidação do ferro, seja de minerais que contêm ferro dentro da própria pedra, seja de objetos metálicos externos em contato com a pedra. Essas manchas distintivas de cor laranja-marrom podem ser extremamente persistentes e requerem um tratamento especializado. A ferrugem interna ocorre quando a pirita de ferro ou outros minerais de ferro dentro da pedra oxidam devido à exposição à umidade.